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主人公、沢木 惣右衛門 直保は、空気中の菌が目に見えるという特殊な体質の持ち主。
もやし（種麹）屋の息子である彼は、幼なじみで造り酒屋の息子・結城 蛍とともに農業大学進学のため東京にやってきた。
入学式当日、祖父からのメモに書かれた樹という人物に会いに行く二人。
祖父と古くからの知り合いという樹は、菌について語りだすととまらない、
ちょっと奇異な老教授だった。
その後、樹研究室に出入りするようになった沢木は、新たな「菌」と「発酵」の世界に触れながらも、彼を取り巻く少し変わった人たちとの出会いによって、様々な騒動に振り回されていくことに（公式サイト）（Wiki）

2007年10月〜　フジテレビ

原作：石川雅之
監督：矢野雄一郎
シリーズ構成：高橋ナツコ
アニメーション制作：アームス

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第1話　「農大菌物語」

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第2話　「三億円の農大生」

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第3話　「菌でかもすぞ!」

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第4話　「あちこち菌祭り」

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第5話　「怪奇!菌オバケ」

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第6話　「悩殺!ミス農大」

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第7話　「開幕!農大春祭」

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第8話　「農大正門攻略戦」

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第9話　「柔肌にとりつけ」

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